宇宙世紀0092年、外郭新興部隊「ロンド・ベル」のモビルスーツ隊隊長として、リ・ガズィやνガンダムを駆り、歴戦の名艦長ブライト・ノアらと共に、シャア・アズナブル率いるネオ・ジオンとの戦いに挑む。当時の階級は大尉。
宇宙世紀0093年3月12日、シャアのサザビーを激しい一騎打ちの末撃破し、その脱出ポッドを捕獲したまま地球へ落下していくアクシズの片割れをνガンダムで押し出そうとする。そのとき観測された、地球を取り囲むほどの規模の光の虹（サイコフレームの共振現象とも言われるが詳細は不明）と共にアクシズは奇跡的に軌道を変え、地球への落下を防ぐことに成功したが、アムロ自身はシャアと共に行方不明となった。連邦軍の公式記録では戦死したことになっており、以後の消息は語られていないが、伝説的英雄の生存を信じ続ける者は少なくなかったという。
