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高機動型ザクII 後期型プロトタイプは、MSVにおいて設定されたモビルスーツ。MS-06R-2 高機動型ザクII 後期型のプロトタイプモデルであり、06R-2の1号機である。

ビーム兵器の運用を前提として設計され、胸部形状が大型化しているが、核融合炉の出力に問題があり、通常兵装を装備したR-2型が開発された。